O IPPEM, desenvolve estudos monográficos e projectos de investigação, em cooperação com instituições públicas e privadas de âmbito cultural e científico.
Também presta consultoria externa e apoio à organização de actividades culturais, tratamento de documentação arquivística entre outros serviços, dedicando-se ainda à produção de inventários e à realização de estudos e relatórios.
Desenvolve formação em diversos domínios, procurando valorizar o estudo sobre temas mariológicos e da História do culto à Padroeira de Portugal.
É orientado por uma equipa de investigadores qualificados, integrando colaboradores provenientes de outras unidades científicas.